生物信息快速入门班 | 转录组与表达数据挖掘专题开班啦

春天，是万物生长的季节~

作为科研人的我们，也需要通过学习新知识，积淀新技能来开启这新的一年！

联川生物本次特邀经验丰富、授课技巧一流的基因课讲师团队，为大家带来为期5天的录组与表达数据挖掘专题培训班

本次培训班前2天为零基础课程，注意哦~是0基础，后3天为转录组与表达数据挖掘专题，小白们可以通过此次培训得到技能的升华。

转录组是生物医学测序应用最多的领域，也是生物信息技术最为成熟的方向，无论是动植物研究，还是医学研究者都适合参加此次培训。培训班的课程设置也非常适合零基础学员参加，通过5天的系统培训学习让你从入门到精通，自行完成转录组基本分析以及表达数据的深度挖掘与绘图。欢迎全国生命科学、基础医学、生态、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事生物、医学等研究、开发和教学的第一线科研人员报名参加！

培训信息

特邀讲师团队：基因课张旭东老师

培训时间：2019年4月17-21日，9:00-17:30

培训地点：杭州江干区6号大街260号正泰中自科技园19幢2楼大会议室

注意：小班教学，本次仅招生36人哦~

【课程内容大纲】

课前预习：

提前预习基因课视频（www.genek.tv）、安装软件

1. 视频课程：《生物信息入门之 Linux》

2. 视频课程：《生物信息软件安装》

3. 视频课程：《测序数据过滤和质控》

4. 服务器安装：trinity、bowtie2、RSEM、Hisat2、subread、DESeq2、edgeR

5. 个人电脑安装：IGV

第一天：Linux 基础

1. 测序原理：illumina、PacBio、Nanopore、MGISeq

2. 计算机基础：CPU、内存、硬盘、核、进程、线程、并行计算等

3. Linux 常用命令

4. 生物信息软件安装

第二天：基本分析

1. 高级生物信息命令：grep、sort、awk、sed 等

2. 任务练习：测序数据过滤和质控

3. 任务练习：比对到参考基因组（Hisat2 的使用）

4. 任务练习：表达定量（featureCounts 的使用）

5. 可视化：IGV 的使用

第三天：原理和标准分析

1. 方案设计：测序量与生物学重复

2. 方案设计：混池测序

3. 基本原理：FPKM、TPM、TMM

4. 解读公司结题报告

5. 分析实操：自主开发的基于 Snakemake 的一键式转录组分析流程

第四天：深度挖掘（上）

1. 差异表达分析：DESeq2、edgeR，一键式差异分析程序

2. 功能注释：功能注释和GO、Pathway、KOG/COG 分类

3. 富集分析：ClusterProfiler包的使用

4. 富集分析：适合所有物种的富集分析方法

第五天：深度挖掘（下）

1. 主成分分析：降低数据维度，简化分析

2. 聚类分析：锁定关键基因和关键样本

3. WGCNA：加权共表达网络分析

培训特色

• 提供自编生物信息教材

• 赠送 17 门视频课程，供课前预习、课后进一步深入学习

• 赠送高性能云平台一年使用权，所有分析软件均免费使用

报名时间

2019.03.13~2019.04.15日

报名方式

1.   微信公众号报名：关注联川公众号，对话框回复：培训+姓名+单位+电话；

2.   邮件报名[e-mail]：邮件主题“培训报名”，正文：姓名+单位+电话；

3.   委托联川驻各地科技代表报名；

4.  联系黄女士：18506829175（微信同），直接报名预约。

收费标准

培训费：4500/人（包含教材、午餐，其他食宿自理）

优惠政策：

• 前10人报名，每人优惠 500元，以收到款项为准

• 3人以上组团报名，每人优惠100元

• 往期培训班学员报名，每人优惠 100元

• 5人以上组团报名，另送一位免费培训名额

注意：以上优惠政策不可同享。

• 将本文转发朋友圈，并截图发到公众号后台，再额外优惠 100元（与上面的优惠政策可同享）。

注意事项：讲师演示电脑为windows系统，故需携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。

注意事项

• 请在培训开始前全额支付培训费。由于名额有限，过期未缴费者，名额将无法保留哦
  

• 支付方式：对公转账，账号信息如下，

       账户：杭州联川生物技术股份有限公司

       账号：383158327308

       开户行：中国银行杭州经济技术开发区支行

      注意：汇款单上请备注您的姓名，以便核对。

• 发票开票内容：技术服务培训费、生信技术服务培训费、miRNA技术服务培训费，测序分析费等。

• 其他：可提供培训通知、会议通知、合同等。

讲师简介

张旭东老师：

一线工程师、CNS一作授课

曾任华大基因项目组组长、产品研发组组长。2017年创办专业培训机构，专注生物信息学培训。

发表文章：麻疯树基因组计划（the plant journal）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。

培训经历：已完成14门视频课程的开发，累计学员3000余人。在武汉、成都、西安、杭州、广州、北京等地举办快速入门班11期、周末成长班2期。培训对象包括医生、学生、科研工作者以及生信爱好者等。

张老师授课方式幽默风趣，将非常烧脑的生信原理讲得通俗易懂，欢迎各位感兴趣的小伙一起来感受干货满满的课堂。

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